Пълният набор от документи, който земеделските стопани кандидатстващи за подпомагане за биологично производство не е малък, но е изпълнимо стопаните да го съберат. Експертите на Министерство на земеделието, храните и горите отговарят на системата ИСУН какви са документи трябва да бъдат представени от контролиращият орган.
За проекти с включени разходи за биологично производство, условието се счита за изпълнено, когато кандидатът представи договор за контрол по смисъла от Закона за прилагане на Общите организации на пазарите на земеделски продукти на ЕС с контролиращо лице, получило разрешение от министъра на земеделието и храните за осъществяване на контрол за спазване правилата на биологичното производство. Представят се също копие от сертификационно писмо от контролиращото лице, сертификат, че кандидатът е производител на продукт/и, сертифициран/и като биологичен/и или друг документ издаден от контролиращо лице, удостоверяващ че земята/площите и отглежданите култури и/или наличните животни, с които е обосновано ползването на инвестициите, свързани с производство на биологични продукти, са предмет на контрол към датата на кандидатстване и са сертифицирани като биологични.
Договорът, сертификатът или други документи издадени от контролиращото лице следва да бъдат за дейностите, продукцията и инвестициите по проектното предложение, което е обект на подпомагане.