Правителството прие правилник за организацията и дейността на Координационния съвет по водите. Координационният съвет е създаден със Закона за изменение и допълнение на Закона за водите с цел интегрирането на политиката по водите и отрасловите политики във водния сектор. Той следва да осигури координация на дейностите по разработване и изпълнение на плановете за управление на речните басейни (ПУРБ) и плановете за управление на риска от наводнения (ПУРН).
Съветът координира и дейностите по финансиране и изпълнение на включените в плановете мерки за опазване и възстановяване на водите, и за намаляване на вероятността и неблагоприятните последици от наводнения. Той разглежда доклади от областните управители за състоянието на водната инфраструктура и резултатите от контролната дейност.
Председател на Координационния съвет по водите е министърът на околната среда и водите. В него са включени министрите на земеделието и храните, на енергетиката, на икономиката, на регионалното развитие и благоустройството, на здравеопазването, на вътрешните работи, на транспорта, информационните технологии и съобщенията, на образованието и науката, и председателят на Националното сдружение на общините в България.
Съветът провежда редовни заседания по предварително установен годишен график за работа, приет на негово заседание. Председателят може да свиква и извънредни заседания.