Изпълнителната агенция по рибарство и аквакултури е изключена като междинно звено на Управляващия орган на Програмата за морско дело и рибарство, а за одитен орган за програмата е определена Изпълнителна агенция „Сертификационен одит на средствата от Европейските земеделски фондове“. Тези промени стават официално част от рибарската програма, след като правителството прие Решение за изменението й.
В мотивите си към решението от Министерски съвет посочват, че измененията имат за цел да подобрят управлението и отчитането на резултатите от прилагането на ПМДР.
Нанесени са и технически корекции, с които се премахва дублиране в различните текстове на индикатори за резултат по проектите, като промяна на горивната ефективност на плавателния съд при риболов, промяна в стойността на продукцията от аквакултури и промяна в нетната печалба на бенефициента. Допълнени са липсващи индикатори като създаване на работни места и други.
